اعتمد قطاع المعاهد الأزهرية نظام البكالوريا في الأزهر الشريف، وحدد مواد الصف الأول والثاني والثالث الثانوي وفق التوزيع الشرعي والعربي والثقافي والتخصصي، مع وجود مواد لا تُضاف للمجموع ومادتين تتغيران بين الفصول.
أولاً: الصف الأول الثانوي
المواد الشرعية.
- القرآن الكريم
- التوحيد والمنطق القديم
- التفسير وعلوم القرآن
- الحديث وعلومه
- الفقه
- الثقافة الإسلامية (للفصل الدراسي الأول فقط)
المواد العربية.
- النحو
- الصرف
- البلاغة
- الأدب وفنون الكتابة
المواد الثقافية.
- العلوم المتكاملة
- التاريخ المصري
- الرياضيات
- الفلسفة والمنطق
- اللغة الأجنبية الأولى
وتشمل الخطة مواد لا تُضاف للمجموع:
– البرمجة والذكاء الاصطناعي
– اللغة الأجنبية الثانية (للفصل الدراسي الثاني فقط).
كما ورد أن إجمالي المواد: (15) مادة مضافة للمجموع + مادتين لا تُضافان للمجموع, إضافة إلى مادة المستوى الرفيع (خاص بالمعاهد النموذجية).
ثانياً: الصف الثاني الثانوي
.1 المواد الأساسية (المقررة على جميع الشعب).
- المواد الشرعية: القرآن الكريم، التوحيد، التفسير، الحديث، الفقه.